2017年4月24日至5月24日，中央第六环境保护督察组对湖南省开展环境保护督察，并于2017年7月31日向湖南省委、省政府进行反馈时指出，洞庭湖区生态环境问题严峻，东洞庭湖国家级自然保护区违规采砂问题突出。

中央第六环境保护督察组指出，与2013年相比，2016年洞庭湖Ⅲ类水质断面比例从36.4%下降为0，东洞庭湖国家级自然保护区违规采砂问题突出。

采砂作业不断蚕食侵占湿地洲滩，越冬雁类重要栖息地雁子洲已被挖除约4000亩。

2016年8月至9月，岳阳市灏东砂石公司非法侵入东洞庭湖自然保护区核心区，侵占保护区核心区160亩。

湖南张家界大鲵国家级自然保护区仍有非法采砂项目29个，水电项目67个，由于生态环境遭到破坏，大鲵的天然出苗点较保护区成立之初大幅减少。

益阳大通湖水面82.7平方公里，是洞庭湖区最大的内湖。但益阳市对大通湖天泓渔业公司围网养殖监管不力，企业大量投放饲料、肥料，造成水质从2013年Ⅲ类下降为2016年劣Ⅴ类。

常德珊珀湖2013年确定为饮用水备用水源地，但相应管理不到位，一些养殖企业持续投肥养殖，导致湖水水质长期为劣Ⅴ类。

华容河是洞庭湖一级支流，受生活污水、工业废水、畜禽养殖污染影响，河流入湖六门闸断面水质从2015年Ⅲ类恶化为2016年Ⅳ类。

督察组还对发现的生态环境损害责任追究问题进行了梳理，已按有关规定移交给湖南省省委、省政府。